Maîtriser les indications du caryotype

1. Quand demander un caryotype standard ?
2. Quand demander un caryotype en haute résolution ?
3. Quand demander un examen en cytogénétique moléculaire ?

1) Quand demander un caryotype standard ?

1.1 Diagnostic prénatal

L'examen peut être réalisé soit sur villosités choriales dès la 11e - 12e semaine d'aménorrhée, soit sur amniocytes à partir de la 14e - 15e semaine, soit enfin sur sang foetal après la 20e semaine. Ces techniques de prélèvement invasives sont toutes associées à un risque de fausse couche (0,5 % - 1 % des cas pour l'amniocentèse, 1 % à 1,5 % pour la biopsie de villosité choriale, 3 % - 5 % pour la ponction de sang foetal) qui les réservent à des situations associées à un risque accru d'anomalie chromosomique foetale. Ces indications sont précisées dans un texte de loi

         . âge maternel supérieur ou égal à 38 ans le jour de la ponction

         . signe d'appel biologique (risque calculé supérieur à 1/250 après dosage des marqueurs sériques)

         . signe d'appel échographique (toute anomalie morphologique pourra donner lieu à une prise en charge de l' amniocentèse , mais toutes les anomalies échographiques ne sont pas des indications au caryotype prénatal)

         . antécédent d'enfant porteur d'une anomalie chromosomique

         . caryotype parental remanié

         . diagnostic de sexe pour les maladies liées à l'X sans diagnostic possible par biologie moléculaire

1.2 Diagnostic constitutionnel        

Le caryotype constitutionnel n'est pas soumis à une législation particulière comme le diagnostic prénatal. Les indications peuvent donc être très diverses et nous nous limiterons aux plus fréquentes.

         . syndrome polymalformatif, dysmorphie faciale, retard mental, isolés ou associés

         . clinique évocatrice d'un syndrome chromosomique

         . infécondité, fausses couches à répétition

         . ambiguïté sexuelle, transsexualisme

         . enquête familiale lors de la découverte de certaines anomalies équilibrées ou déséquilibrées

1.3 Hématologie, cancérologie

Les processus cancéreux sont très souvent associés à des remaniements chromosomiques, parfois spécifiques ( chromosome Philadelphie de la leucémie myéloïde chronique par exemple, qui résulte d'une translocation t(9;22) ).

Au cours des processus tumoraux, le caryotype peut donc présenter un intérêt

         . diagnostic (mise en évidence d'une anomalie spécifique d'une pathologie)

         . pronostic (certaines formules chromosomiques sont associées à des formes d'évolution favorables ou au contraire défavorables)

         . thérapeutique notamment en hématologie ou il permet d'évaluer la maladie résiduelle et donc l'efficacité du traitement.

2) Quand demander un caryotype en haute résolution ?

Le caryotype en haute résolution est un examen de deuxième intention, toujours réalisé après un caryotype standard. Son indication est posée dans deux situations principales :

         * préciser les points de cassures d'un remaniement dépisté sur un caryotype standard ;

         * rechercher un micro remaniement quand la clinique évoque très fortement l'existence d'une anomalie chromosomique alors que le caryotype standard est normal. Dans cette situation, la haute résolution présente l'avantage sur la cytogénétique moléculaire de pouvoir analyser tous les chromosomes, sans avoir à être précisément orienté vers une région particulière au préalable.

3) Quand demander un examen en cytogénétique moléculaire ?   

L'utilisation de sondes moléculaires en cytogénétique est le plus souvent décidée dans le but de préciser une anomalie découverte ou suspectée lors d'un caryotype standard ; il s'agit donc le plus souvent d'un complément technique mis en oeuvre par le laboratoire. Il existe cependant des situations ou l'hybridation in situ ( FISH pour Fluorescence in situ Hybridisation) est réalisée de première intention : c'est le cas des syndromes microdélétionnels pour lesquels cette technique est le moyen le plus fiable de faire le diagnostic.

En pratique cependant, seules certaines régions du génome sont accessibles à une analyse de routine, celles qui sont impliquées avec une certaine fréquence dans des syndromes cliniques et pour lesquelles des sondes existent déjà.

Principaux syndromes microdélétionnels accessibles au diagnostic en routine :

Syndrome de Wolff Hirschorn (délétion 4p)

Syndrome du Cri du Chat (délétion 5p)

Syndrome de Williams (délétion 7q)

Rétinoblastome (délétion 13q)

Syndromes de Prader Willi et Syndrome d'Angelman (délétion 15q)

Syndrome de Smith Magenis (délétion 17p)

Syndrome de Miller Dieker (autre délétion 17p)

Syndrome de DiGeorge, Syndrome Vélo cardio facial (délétion 22q)

Syndrome de Kalmann (délétion Xp)

Syndrome de Léri Weill (délétion de l'extrêmité terminale des chromosomes X ou Y)