Causes d'absence d'expression des gènes soumis à empreinte :

les mutations des centres d'empreinte

La mise en place correcte de la méthylation dans les régions soumises à empreinte se fait sous le contrôle d'un ou de plusieurs centres d'empreinte. Toute mutation de ces séquences peut perturber leur fonctionnement et aboutir à l'absence de mise en place de l'empreinte attendue.

Dans cet exemple concernant le chromosome 15, une mutation du centre d'empreinte sur le chromosome 15 paternel entraîne la mise en place d'une empreinte de type maternel dans cette région, bien qu'il soit transmis via une lignée germinale masculine. Dans ce cas, puisque porteur d'une empreinte de type maternelle, ce chromosome transmis par le père n'exprimera pas SNRPN mais UBE3a. Ceci aboutit à la même situation que la disomie uniparentale, bien que les deux chromosomes soient hérités des deux parents.