Compétition pour une séquence régulatrice

Les ARN antisens semblent être associés à une majorité de gènes soumis à empreinte et peuvent participer à la régulation de l'expression de plusieurs façons différentes.

Un des mécanisme consiste en une compétition des promoteurs du gène sens et de l'antisens pour une même séquence régulatrice.

Sur l'allèle déméthylé (ici l'allèle paternel), les deux promoteurs sont activés par ces séquences (ovales verts), mais si l'affinité du promoteur antisens pour les protéines régulatrices est plus forte que celle du promoteur sens, seul l'antisens sera activé et le gène ne sera pas transcrit.

En revanche, si une DMR est associée au promoteur de l'antisens, sur l'allèle méthylé (ici l'allèle maternel) cet antisens ne pourra pas être activé par les protéines régulatrices puisque la chromatine sera compactée et donc ces protéines seront disponibles pour activer le promoteur du gène sens qui sera transcrit.