Méthylation d'une séquence régulatrice

Les DMRs qui contrôlent l'expression des gènes soumis à empreinte peuvent être à distance de ceux-ci et agir indirectement en modulant l'action de séquences régulatrices.Ces séquences peuvent activer ou inhiber l'expression du gène grâce à des protéines de liaison qui se fixent sur l'ADN. Si le site de fixation est situé au niveau d'une DMR,son accessibilité sera régulée par l'état de méthylation de la DMR.

Dans cet exemple, une DMR est située au niveau du site de fixation de protéines inhibitrices (en rouge). Sur l'allèle maternel, la DMR est déméthylée et les protéines peuvent se fixer, ce qui entraîne une suppression de la transcription. Au contraire, sur l'allèle paternel qui est méthylé (ovales jaunes), la chromatine au niveau de la DMR est compactée ce qui rend inaccessible le site de fixation aux protéines inhibitrices. Par conséquent, elles ne peuvent pas jouer leur rôle et la transcription reste active sur cet allèle.

Cet exemple de la méthylation d'un site répresseur de la transcription illustre le fait que l'équation méthylation = répression transcriptionnelle ne doit pas être considérée comme un dogme absolu. C'est exact le plus souvent, mais il faut garder à l'esprit que tout dépend du rôle fonctionnel de la région méthylée.